澳门金砂平台建立了一整套较为科学的管理制度和程序，初步形成了较为完善的技术创新体系，以澳门金砂平台集团新药研究开发有限责任公司（新药公司）为核心在内部三个层次上开展技术创新工作。

一级研发以新药公司为主，通过资源整合,形成专业突出,分工明确的小试实验室和中试基地,主要承担对公司发展战略有重大影响的中长期科研开发项目和公共技术平台建设及基础应用研究，承担项目立项、小试、中试、生产转化及产品上市后的技术支撑，相关药品的注册工作，生产性试验工作,引进技术的消化吸收和再创新，努力满足生产对新技术的要求,为成果转化架起桥梁,为二、三级研发机构提供技术指导。

二级研发以组建的链式专业化公司的研发机构为主，主要进行在短期内能够实现产业化的新产品开发、新技术的引进、消化、吸收和再创新。

三级研发以车间实验组为主，主要解决生产瓶颈问题，以生产试验和改进生产工艺为主要任务，重点解决在日常生产过程中生产工艺和产品质量问题，提高生产指标，降低成本，提高产品质量。

三级研发机构之间相互支撑，实现资源共享，建立完整的“新药和新技术原始创新—新产品研制开发—中试研究—产业化”技术体系。